Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCF11O94913 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCF11O94913 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCF11O94913 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCF11O94913 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PCF11O94913 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCF11O94913 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCF11O94913 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCF11O94913 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCF11O94913 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCF11O94913 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCF11O94913 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCF11O94913 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCF11O94913 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCF11O94913 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCF11O94913 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCF11O94913 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCF11O94913 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCF11O94913 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCF11O94913 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PCF11O94913 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PCF11O94913 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PCF11O94913 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCF11O94913 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCF11O94913 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCF11O94913 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms