Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp6O88572 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp6O88572 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp6O88572 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp6O88572 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp6O88572 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrp6O88572 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp6O88572 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms