Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SURF6O75683 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SURF6O75683 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SURF6O75683 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SURF6O75683 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SURF6O75683 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF6O75683 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SURF6O75683 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SURF6O75683 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SURF6O75683 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SURF6O75683 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SURF6O75683 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SURF6O75683 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SURF6O75683 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SURF6O75683 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms