Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR5O75473 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR5O75473 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR5O75473 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR5O75473 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR5O75473 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR5O75473 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR5O75473 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR5O75473 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR5O75473 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR5O75473 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR5O75473 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGR5O75473 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR5O75473 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms