Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITX3O75364 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITX3O75364 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITX3O75364 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITX3O75364 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PITX3O75364 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms