Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORBS3O60504 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORBS3O60504 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms