Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MARCH6O60337 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH6O60337 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms