Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSH5O43196 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSH5O43196 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSH5O43196 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MSH5O43196 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MSH5O43196 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSH5O43196 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSH5O43196 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSH5O43196 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSH5O43196 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms