Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP3O14828 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP3O14828 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms