Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.578e-17■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 218.5■□□□□ 0.558e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SLC12A9-205ENST00000434158 589 ntTSL 418.4■□□□□ 0.546e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-214ENST00000553221 675 ntTSL 318.31■□□□□ 0.528e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-205ENST00000525170 552 ntTSL 318.26■□□□□ 0.512e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-210ENST00000534080 1379 ntTSL 218.25■□□□□ 0.516e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-216ENST00000532173 805 ntTSL 218.09■□□□□ 0.492e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-18■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-208ENST00000477564 2096 ntTSL 217.81■□□□□ 0.446e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-205ENST00000416156 1669 ntTSL 217.26■□□□□ 0.356e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 NFKBIA-210ENST00000557459 780 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-18■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.29e-12■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ICAM1-204ENST00000588645 581 ntTSL 216.28■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-210ENST00000550528 534 ntTSL 316.18■□□□□ 0.188e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-10■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-207ENST00000548093 457 ntTSL 415.4■□□□□ 0.068e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.056e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -08e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-212ENST00000552816 582 ntTSL 415.01□□□□□ -0.018e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-209ENST00000549052 1100 ntTSL 315.01□□□□□ -0.018e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 514.94□□□□□ -0.028e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-18■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 POFUT2-212ENST00000493811 577 ntTSL 314.82□□□□□ -0.048e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-203ENST00000546993 2026 ntTSL 214.8□□□□□ -0.048e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-12■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 FBXO6-202ENST00000449067 928 ntTSL 314.56□□□□□ -0.088e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 214.44□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-204ENST00000547311 438 ntTSL 314.2□□□□□ -0.148e-17■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 OBSCN-207ENST00000483539 4779 ntTSL 513.88□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-209ENST00000527167 1712 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.218e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.36e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 513.14□□□□□ -0.318e-17■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.369e-12■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-14■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TSPAN31-213ENST00000553089 820 ntTSL 512.25□□□□□ -0.458e-17■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-15■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.838e-17■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 ME2-215ENST00000639688 4344 ntTSL 58.78□□□□□ -16e-9■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-205ENST00000596583 490 ntTSL 37.82□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.246e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.286e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-211ENST00000601731 405 ntTSL 37.04□□□□□ -1.286e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-201ENST00000336942 601 ntTSL 56.51□□□□□ -1.376e-9■■■■■ 39.9
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DDX3XO00571 MIER3-210ENST00000497185 108 ntTSL 56.25□□□□□ -1.416e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-203ENST00000595207 526 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.496e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.56e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.566e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.566e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.576e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.12□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-209ENST00000480115 394 ntTSL 55.1□□□□□ -1.596e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-211ENST00000546593 244 ntTSL 54.83□□□□□ -1.646e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.646e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-208ENST00000452157 5240 ntTSL 1 (best)3.67□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.936e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-206ENST00000440000 219 ntTSL 52.93□□□□□ -1.946e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.046e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.066e-9■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.524e-14■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 TADA2B-202ENST00000506692 558 ntTSL 212.11□□□□□ -0.474e-14■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 CD55-202ENST00000343420 978 ntTSL 517.21■□□□□ 0.356e-12■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.532e-8■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 IFNGR2-205ENST00000439213 906 ntTSL 521.8■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 39.9
DDX3XO00571 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 39.9
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