Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28051J3QMA2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm28051J3QMA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28051J3QMA2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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