Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C1W4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
H7C1W4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C1W4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C1W4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C1W4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C1W4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C1W4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C1W4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C1W4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C1W4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms