Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD3A6NKT7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms