Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCHNA4D1U4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms