Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAI2Q9Y5P3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAI2Q9Y5P3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms