Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FZD1Q9UP38 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
FZD1Q9UP38 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FZD1Q9UP38 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms