Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX4Q9UIU6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX4Q9UIU6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms