Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO3A1Q9UIG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO3A1Q9UIG8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO3A1Q9UIG8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms