Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX20Q9UHI6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX20Q9UHI6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms