Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF1Q9UBU9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms