Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLKQ9UBT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms