Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy2Q9QXT0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy2Q9QXT0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy2Q9QXT0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms