Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX56Q9NY93 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX56Q9NY93 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms