Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D2Q9NY47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms