Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
C1orf109Q9NX04 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf109Q9NX04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf109Q9NX04 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms