Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2orf42Q9NWW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms