Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGB3Q9NQW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB3Q9NQW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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