Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL3Q9NQ33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms