Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms