Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE7BQ9NP56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE7BQ9NP56 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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