Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNDC4Q9H6D8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FNDC4Q9H6D8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms