Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
EBF3Q9H4W6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBF3Q9H4W6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms