Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF41Q9H4P4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF41Q9H4P4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF41Q9H4P4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF41Q9H4P4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms