Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCAD1Q9H4L7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCAD1Q9H4L7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms