Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNMDQ9H2S6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms