Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms