Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1EQ9GZS1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms