Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn10Q9ESK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn10Q9ESK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms