Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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