Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR2Q9BYE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR2Q9BYE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR2Q9BYE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms