Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRIP1Q9BX63 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRIP1Q9BX63 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms