Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP2Q9BSJ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms