Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YME1L1Q96TA2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YME1L1Q96TA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YME1L1Q96TA2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms