Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAPLN3Q96S86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAPLN3Q96S86 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms