Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ALS2Q96Q42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALS2Q96Q42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms