Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX27Q96L92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms