Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF2Q96GP6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms