Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC39Q96DD0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms