Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRAMD1AQ96CP6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRAMD1AQ96CP6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms