Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC4Q92889 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC4Q92889 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms